Genotypové a fenotypové vlastnosti bakteriálního kmene Rhodococcus degradans a možnosti jeho biotechnologických aplikací v metodách biotěžby kovů

Abstract

Je známo, že bakteriální společenstva tvoří důležitou součást biosféry planety Země, ale jejich konzistence a druhové variace jsou málo prozkoumány. Disertační práce se zabývá genotypovými a fenotypovými vlastnostmi bakteriálního kmene Rhodococcus degradans. Praktická část práce se věnuje základním charakteristikám bakteriálního kmene Rhodococcus a dále reakcím bakterií na prostředí s kovy (biosorpce, bioakumulace, biovolatizace). Experimentální část je rozčleněna na čtyři hlavní kapitoly (morfologické vlastnosti Rhodococcus degradans, genotypové, fenotypové a další fyziologické charakteristiky kmene), výsledky a diskuzi. Základní genotypizace kmene byla prováděna s využitím univerzálních primerů 16S rRNA. Fenotypové vlastnosti byly zjišťovány s využitím moderního testovacího systému BIOLOG MicroStation a srovnány s nejbližšími druhy v rámci dosud známého taxonomického postavení kmene. Mezi další fyziologické charakteristiky jsou řazeny rezistenční, biodegradační a bioloužící studie. Na závěr je uvedeno shrnutí a nastínění možného využití tohoto bakteriálního kmene.

It is known, that bacterial communities constitute an important part of the biosphere of the Earth, but their consistency and generic variations are little explored. Dissertation engages in genotypic and phenotypic characteristics of the bacterial strain Rhodococcus degradans. The practical part is focused on the basic characteristics of the bacterial strain Rhodococcus and then on reactions of the bacteria to the environment with metals (biosorption, bioaccumulation, biovolatization). The experimental part is divided into four main chapters (morphological properties of Rhodococcus degradans, genotypic, phenotypic and other physiological characteristics of the strain), results and discussion. Basic genotyping of the strain was carried out with use of the universal primers of the 16S rRNA. Phenotypic properties were detected with use of modern testing BIOLOG MicroStation system and were compared with the closest types within so far known taxonomic position of the strain. Resistance, biodegradation and bioleaching studies are ranked among other physiological characteristics. In conclusion there is given a summary and outline of the possible use of the bacterial strain.