Extrakce objektů z medicínských obrazů na základě metody aktivních kontur

Abstract

Tato bakalářská práce řeší problematiku extrakce artikulární chrupavky ze snímku kolenního kloubu pořízeného magnetickou rezonancí. Pro účely segmentace je použita poloautomatická metoda aktivních kontur, implementovaná v prostředí MATLAB. V práci je porovnávána efektivita použití základních metod předzpracování obrazu pro zlepšení výsledků segmentace aktivními konturami. Následná extrakce je řešena binarizací barevné mapy, která je jedním z výsledků segmentace. Extrahovaná plocha je následně validována manuální segmentací. Jedním z dílčích úkolů práce je ověření, zdali jsou aktivní kontury schopny detekovat počínající patologické stavy chrupavky. Metodu lze výhledově využít v diagnostice, při volumetrických měřeních nebo při tvorbě 3D modelů chrupavek.

This bachelor thesis is focused on the articular cartilage extraction from the knee image records acquired by the magnetic resonance (MR). A semi-automatic method based on the active contour is used for the segmentation purposes. The segmentation algorithm is implemented in the SW MATLAB. In the thesis, an effectivity of basic image preprocessing methods is compared with the aim of improving the segmentation results by the active contour model. The consequent extraction of articular cartilage is based on the binarization of the color map which represents one of the segmentation results. The extracted area is consequently validated on the base of the manual segmentation. One of the issue is the validation weather the active contour method is able to detect the early articular cartilage pathological changes. The method has ambitions to be used in the clinical practice in volumetric measurements, or 3D articular cartilage models.