Analýza a komprese dat z optického mapování

Abstract

Tato diplomová práce se zabývá analýzou, zpracováním a kompresí dat, která jsou výsledkem optického mapování. Cílem je pomocí analýzy vyhodnotit a navrhnout, jaké kompresní postupy je možné zvolit za účelem dosažení co nejefektivnějšího kompresního poměru. Mimo běžné kompresní algoritmy jsou aplikovány také další vlastní úpravy jednotlivých souborů. Výsledkem je program, který umožní zkomprimovat výsledky optického mapování společnosti Bionano Genomics.

This master's thesis deals with analysis, processing, and compression of data resulting from optical mapping. The goal is to analyze and propose which compression methods can be chosen to achieve the most efficient compression ratio. In addition to common compression algorithms, custom modifications to individual files are also applied. The result is a program that allows compressing outputs of Bionano Genomics optical mapping process.