Tvorba nástroje pro vyhodnocení migračních charakteristik buněk z časosběrných mikroskopických snímků

Abstract

Tato práce se zaměřuje na zprostředkování metody wound healing assay, laboratorní metody pro studium migrace buněk během hojení ran, interaktivní formou. Nově vyvinutá aplikace umožňuje nejen sledovat uzavírání rány, ale také analyzovat pohyb jednotlivých buněčných populací na základě jejich polohy vůči okraji rány. Pracuje s časosběrnými snímky z jasného pole a fluorescenční mikroskopie a poskytuje výsledky formou názorných vizualizací a grafů. Hlavní účel je poskytnout uživateli přístupné a intuitivní uživatelské rozhraní pro vyhodnocování testů hojení ran (scratch wound healing assay).

This work focuses on presenting the wound healing assay method — a laboratory technique for studying cell migration during wound healing — in an interactive form. The newly developed application not only enables the monitoring of wound closure but also analyzes the movement of individual cell populations based on their distance from the wound edge. It processes time-lapse images from bright-field and fluorescence microscopy and provides results in the form of clear visualizations and graphs. The main goal is to offer a user-friendly interface for evaluating scratch wound healing assays.