Analýza a komprese dat z optického mapování

dc.contributor.advisorVašinek, Michal
dc.contributor.authorKotásek, Ondřej
dc.contributor.refereeDvorský, Jiří
dc.date.accepted2024-08-06
dc.date.accessioned2024-10-08T08:41:04Z
dc.date.available2024-10-08T08:41:04Z
dc.date.issued2024
dc.description.abstractTato diplomová práce se zabývá analýzou, zpracováním a kompresí dat, která jsou výsledkem optického mapování. Cílem je pomocí analýzy vyhodnotit a navrhnout, jaké kompresní postupy je možné zvolit za účelem dosažení co nejefektivnějšího kompresního poměru. Mimo běžné kompresní algoritmy jsou aplikovány také další vlastní úpravy jednotlivých souborů. Výsledkem je program, který umožní zkomprimovat výsledky optického mapování společnosti Bionano Genomics.cs
dc.description.abstractThis master's thesis deals with analysis, processing, and compression of data resulting from optical mapping. The goal is to analyze and propose which compression methods can be chosen to achieve the most efficient compression ratio. In addition to common compression algorithms, custom modifications to individual files are also applied. The result is a program that allows compressing outputs of Bionano Genomics optical mapping process.en
dc.description.department460 - Katedra informatikycs
dc.description.resultvelmi dobřecs
dc.format.extent1610309 bytes
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.otherOSD002
dc.identifier.senderS2724
dc.identifier.thesisKOT0242_FEI_N2647_2612T025_2024
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10084/155080
dc.language.isocs
dc.publisherVysoká škola báňská – Technická univerzita Ostravacs
dc.rights.accessopenAccess
dc.subjectkomprese textových datcs
dc.subjectbezztrátová kompresecs
dc.subjectoptické mapovánícs
dc.subjectsekvenování DNAcs
dc.subjectBionano Genomicscs
dc.subjectsoubor .bnxcs
dc.subjectsoubor .cmapcs
dc.subjectsoubor .xmapcs
dc.subjectcompression of textual dataen
dc.subjectlossless compressionen
dc.subjectoptical mappingen
dc.subjectDNA sequencingen
dc.subjectBionano Genomicsen
dc.subject.bnx fileen
dc.subject.cmap fileen
dc.subject.xmap fileen
dc.thesis.degree-branchInformatika a výpočetní technikacs
dc.thesis.degree-grantorVysoká škola báňská – Technická univerzita Ostrava. Fakulta elektrotechniky a informatikycs
dc.thesis.degree-levelMagisterský studijní programcs
dc.thesis.degree-nameIng.
dc.thesis.degree-programInformační a komunikační technologiecs
dc.titleAnalýza a komprese dat z optického mapovánícs
dc.title.alternativeAnalysis and Compression of Data from Optical Mappingen
dc.typeDiplomová prácecs

Files

Original bundle

Now showing 1 - 5 out of 5 results
Loading...
Thumbnail Image
Name:
KOT0242_FEI_N2647_2612T025_2024.pdf
Size:
1.54 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Text práce
Loading...
Thumbnail Image
Name:
KOT0242_FEI_N2647_2612T025_2024_zadani.pdf
Size:
122.5 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Zadání
Loading...
Thumbnail Image
Name:
KOT0242_FEI_N2647_2612T025_2024_priloha.zip
Size:
167.21 MB
Format:
Unknown data format
Description:
Příloha
Loading...
Thumbnail Image
Name:
KOT0242_FEI_N2647_2612T025_2024_posudek_vedouci_Vasinek_Michal.pdf
Size:
147.24 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek vedoucího – Vašinek, Michal
Loading...
Thumbnail Image
Name:
KOT0242_FEI_N2647_2612T025_2024_posudek_oponent_Dvorsky_Jiri.pdf
Size:
151.4 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek oponenta – Dvorský, Jiří