Application for Image Dataset Development Suitable for Biomedical Purposes

Abstract

This thesis presents a web-based application designed to simplify medical image segmentation, specifically for cell image annotation. The system streamlines the process of project management, collaborative labeling, and annotation to support biomedical researchers and non-expert users. It also integrates the U-Net model into the segmentation. By providing an accessible alternative to existing tools, the application improves usability and efficiency in developing biomedical datasets and lays the foundation for future improvements.

Tato práce představuje webovou aplikaci určenou ke zjednodušení segmentace lékařských snímků, konkrétně k anotaci buněčných snímků. Systém zefektivňuje proces řízení projektu, společného ozna čování a anotace, aby podpořil biomedicínské výzkumníky a neodborné uživatele. Do segmentace také integruje model U-Net. Tím, že aplikace poskytuje přístupnou alternativu ke stávajícím nástrojům, zlepšuje použitelnost a efektivitu při vývoji biomedicínských datových sad a vytváří základ pro budoucí vylepšení